有關高等教育工會反映私校教師薪給應加強保障一事，教育部人事處處長張秋元表示，教育部對私校教師權益照顧一向非常重視，相信大多數學校也都依照規定辦理。但為更有效保障私校教師權益，這次透過教師待遇條例立法，把原來以法規命令保障部分，提升以法律來規範，並未減損現有保障的範圍。
除教師之基本薪、敘薪、考核結果的晉級方式等，已強制要求與公立學校一致外，教師待遇條例草案第17條也明確規定，私立學校教師之加給得準用公立學校教師之規定訂定支給數額，並將所定支給數額納入教師聘約，學校在未與教師協議前，不得變更支給數額，並特別規定讓加入工會之教師，不需單獨面對少數不遵守法規的學校，得授權由工會代表協議；且草案第23及24條並增訂未依聘約支給教師薪給之私立學校，其所屬學校財團法人全體董事應就未支給部分與學校負連帶責任，且違反該條例所定應與公立學校一致待遇規範之私立學校，主管機關得按次處以罰鍰10萬元至50萬元，相較於以往僅能以私立學校法第55條規定，扣減私校全部(部分)獎補助或減、停招生名額處理，將更能保障私校教師權益。
張秋元進一步說明，目前依私立學校法施行細則第33條第4項規定，私立學校教師的薪給，準用公立同級同類學校之規定辦理。依最高法院41年10月31日台非字第47號刑事判例，所謂準用是就某事項所定之法規，於性質不相牴觸之範圍內，適用於其他事項，即準用有自然限度。教育部鑑於本（年功）薪為各等級教師領取之基本給與，爰以102年10月24日臺教人（四）字第1020145899B號令釋，私立學校教師薪額給與之月支數額，應不低於公立同級同類學校教師標準，至本（年功）薪以外之其他給與，私立學校得衡酌公立學校教師支給數額標準自行訂定，並同時廢止以往教育部針對私立學校待遇項目及其支給標準，由各校視財務狀況自行訂定標準之函釋，以加強私立學校教師薪資的保障。所以現行私校教師薪給準用公立學校是以本(年功)薪為範圍。
張秋元強調，教育部認為以令釋保障私立學校教師待遇權益仍有不足，因此行政院104年2月25日函送立法院審議之教師待遇條例草案，已將上開教育部令釋，提升至法律位階規範適用，規範更為明確且賦予法律保障，且對於私立學校教師薪給規範，並未變更現行做法。