教育部表示，107年全國軍公教員工待遇調整是經行政院人事行政總處提「軍公教員工待遇審議委員會」審議，簽奉行政院核定後施行，其中各級學校教師學術研究加給，係依以往調整慣例，對照一般公務人員專業加給表（一）相當職等調整情形進行處理，絕無教師團體所稱公教人員差別待遇的問題。
教育部進一步說明，行政院核定107年度軍公教員工待遇調增方案，調增待遇項目包括各類人員的本俸（年功俸）、專業加給（教師為學術研究加給）及主管職務加給等3項。其中軍公教人員薪（俸）額及主管職務加給2項調增比例均為3％。至專業加給（學術研究加給）部分，各類公教人員係循例按一般公務人員專業加給表（一）所列各相當職等增加之相同數額調增。
教育部再強調，本次公立大專校院教授之學術研究加給除依通案調整外，並配合「玉山計畫」將月支數額調增10%，已由54,450元調高至59,895元，希望提高大專教師升等誘因，發揮留任優秀人才功能，以提升教學與研究品質。