教育部「大專校院境外學生輔導人員支援體系計畫辦公室」（NISA）專線電話(0800-789-007)於6月中旬接獲建國科技大學107學年度入學印尼籍學生陳情護照與居留證遭工讀仲介公司扣留並被迫超時工作，同時亦向彰化縣政府1955專線反映，教育部與彰化縣政府均迅即蒐證及查處。教育部除前往學校訪談學生外，並約談學校人員後瞭解，案內印尼籍學生並非產學合作專班學生，係透過一般外國學生管道申請至該校就讀，其工作非屬校外實習課程，而屬學校介紹至廠商工讀，權益遭受嚴重損害。
教育部依查處結果，除將嚴懲建國科技大學外，對於回復印尼籍學生權益受損部分，要求學校承諾立即追回學生被不當扣繳之費用，並提供學生可在臺安心求學之助學措施。有關後續學生就學意願，如留原校就讀或想轉至他校，教育部都將全力提供相關協助。
由於教育部前於108年3月間，針對建國科技大學以代辦費名義向境外學生收取行政管理費及學生超時工作等違失事項，已懲處學校自108學年度起不得招生境外學生。教育部本次再接獲另一批境外學生居留證遭扣及超時工作之陳情後，相當重視且為維護學生權益，旋即於6月20日與學生晤談，並於27日約談學校人員。
教育部根據綜合查證結果，包括19位印尼籍學生一致之證詞、學生工作之薪資發放明細表，以及學校約談紀錄等明確證物，初步認定建國科技大學涉及重大違失事項，其重大違失說明如下：
一、學生嚴重超時工作，學校應為知情：學生每週工讀時數高達48至54小時，學生證詞一致指出學校知情其每週工作嚴重超時，但對外僅得宣稱每週工作20小時，若不從則將被送回印尼。惟學生工讀之廠商係學校介紹，且學校表示知悉廠商於下午課後至夜間及週末，以交通車至學校宿舍接送學生往返。學校宣稱不知學生嚴重超時工作，實有悖常理。
二、學校輔導機制完全失靈，未落實保障境外學生權益：學校宣稱對於學生護照與居留證遭工讀仲介公司（世新國際人力資源有限公司）扣留、學生薪資被工讀仲介公司高額不當扣款等情事，毫無所悉。如確屬實，表示學校不僅未能善盡保障境外學生權益之職責，且校內輔導境外學生之機制，完全失靈無法發揮功能。
三、學生薪資被工讀仲介公司高額不當扣款：根據學生工作薪資發放明細表顯示，學生每月被工讀仲介公司扣取高額不當款項，包括儲蓄學費、學校住宿費、便當費及服務費。但學校表示所扣之儲蓄學費與學校住宿費學校均未收取，其中便當費廠商與學校則均表示未向學生收取，工讀仲介公司恐涉有向學生詐取金錢情事，教育部將轉請檢調單位處理。
教育部對於建國科技大學所涉重大行政缺失，除勒令其限期改善外，並除原已懲處該校自108學年度起不得招收境外學生外，將新增列入專案輔導學校以及扣減相關獎補助經費等懲處措施。至於學校、工讀仲介公司有無構成刑法第339條或第341條詐欺罪、第304條強制罪及違反人口販運法規定等情事，也將轉請檢調單位處理。教育部近日將再前往學校進一步查證，如查有其他重大違失事項，定加重處罰。
對於回復印尼籍學生權益受損部分，教育部要求建國科技大學承諾立即追回學生被扣繳之學費與住宿費、協助學生追討被工讀仲介公司不當扣取之費用，並提供學生可在臺安心求學之助學措施。
教育部表示，自108年1月29日設置境外學生意見信箱（https://form.jotform.me/90622054811449）及服務專線(0800-789-007)以來，迄今共受理諮詢案48件，其中專線諮詢34案、信箱諮詢14案。教育部鼓勵境外學生善加利用以保障自身權益外，也持續不斷要求學校與廠商應遵守相關法令規定，並強調勞動權益與人權紅線不可碰觸，學校要確認沒有違反學生勞動權益或勞動不自主之事項，後續如再有不法或不當事件發生，教育部定將從嚴處分，以維護我國高等教育之聲譽及保障來臺就學學生權益。